Sciences Po Bordeaux est un établissement public à caractère administratif. Le cadre institutionnel de Sciences Po Bordeaux s’organise autour de ses instances :
Conseil d’Administration
Commission Scientifique
L’établissement est dirigé par un directeur nommé pour cinq ans. L’organisation de l’établissement repose sur une équipe d’enseignants, d’enseignants-chercheurs et de chercheurs de haut niveau ainsi qu’une administration qualifiée. Un cadre réglementaire fixe les règles de l’établissement.